El mensaje que muestras indica que el paquete se instaló sin problemas, puedes aclarar por qué piensas que no se ha instalado? Tienes problemas para cargar el paquete?
library(HSAUR2)
Nota: Por favor intenta hacer tus preguntas en inglés, ya que es el idioma preferido aquí y al usar español estás excluyendo a la mayoría de la conversación, reduciendo así tus posibilidades de obtener ayuda.
Cuando dices "pasarlo a PDF" supongo que te refieres a que estas trabajando con un documento Rmd, si ese es el caso, no debes incluir comandos de instalación en tu código, sólo necesitas instalar los paquetes en tu sistema una sola vez, no cada vez que ejecutes tu código.
Para ayudarnos a ayudarte, podrías preparar un "Ejemplo Reproducible" (REPREX en ingles) ilustrando tu problema? Un ejemplo reproducible hace que sea mucho más fácil para otros entender tu problema y averiguar como ayudar.
Por favor revisa esta guía para ver como crear uno: